Afweer is elke reactie van het lichaam tegen een lichaamsvreemde stof. Bacteriën, virussen en gifstoffen zijn voorbeelden van lichaamsvreemde stoffen die het afweersysteem probeert tegen te houden. Afweer kan specifiek tegen één bepaalde ziekteverwekker zijn. Dit noemen we dan de specifieke afweer. Ook heeft het lichaam afweermechanismen die werken tegen vele ziekteverwekkers. Dit is het aspecifieke afweersysteem.