Anaerobe dissimilatie is afbraak van glucose in de mitochondriën zonder zuurstof. Bij anaerobe dissimilatie wordt glucose omgezet in twee organische moleculen melkzuur. Melkzuur zorgt voor beschadiging van de spiervezels. In de lever wordt melkzuur weer opgebouwd tot glucose. Anaerobe dissimilatie levert in vergelijking tot aerobe dissimilatie maar weinig ATP. Let op: anaerobe dissimilatie is feitelijk geen verbranding zonder zuurstof.