Of cellen lichaamsvreemd zijn, hangt af van de MHC-eiwitten op de membraan van deze cellen. Lichaamsvreemde MHC-eiwitten worden door het afweersysteem als lichaamsvreemd herkend en activeren dan het immuunsysteem. Cellen met lichaamsvreemde MHC-eiwitten noemen we pathogenen.